徐云龙1994－1998年效力于北京威克瑞队，当年从威克瑞队加盟国安队的球员中,陶伟、杨璞、徐云龙和邵佳一踢得最出色,他们曾被球迷称为“国安四少”。而当年从威克瑞加盟国安的球员,如今只剩下徐云龙一人,而这么多年一直在国安坚守的也只有徐云龙一人。
1999年，徐云龙进入北京国安，开启了自己漫长的国安生涯。2000年，时任国安主帅的魏克兴经常把身体素质绝佳的徐云龙推上锋线。而在足协杯和联赛中，徐云龙也双线开花，进了许多关键而精彩的球。在客场4-2胜厦门队的比赛中，徐云龙梅开二度，打入了他在甲A联赛中的前2个进球。
2000年4月首次入选米卢蒂诺维奇执教的国家队，备战并参加第12届亚洲杯足球赛，与全队配合获第4名；2001年再度入选国家队，参加韩日世界杯足球赛亚洲区预选赛，全队配合获小组出线权，后因病未能参加十强赛。2002年，徐云龙随队参加韩日世界杯并打满3场比赛。从米卢时期到朱广沪时期一直是国家队主力后卫，为国家队攻入过5个进球。
2004年10月2日，在沈阳举行的中超足球联赛沈阳金德队主场迎战北京现代队的比赛下半场，北京现代队球员因对裁判周伟新的一个点球判罚强烈不满而集体罢赛。在此之前，双方以1比1战平。此后，周伟新因足坛反赌扫黑落网，被判处3年半的刑期。同时，中国足协对其做出了终身禁足的处罚。
2015年8月15日，2015年中超联赛第23轮，北京国安客场挑战石家庄永昌，这是徐云龙代表国安的第400场中国足球顶级联赛比赛，也是中国顶级联赛历史上第一位出场400场球员。
2016赛季中超第21轮的一场补赛，国安做客2-0击败辽足，本场比赛见证了具有纪念意义的一刻。国安队长、37岁的老将徐云龙第500次身披御林军战袍出战。第84分钟，徐云龙换下了于大宝。登场的那一刻，徐云龙也完成了自己的500场里程碑。自1999赛季起，徐云龙已经代表国安一线队征战了整整18个赛季。
2016年12月21日，国安队长徐云龙个人微博中张贴了一张照片，上边写着“决定！2016.12.24”。这位为效力国安18载的老将，疑似将要在3天后宣布是否继续自己的御林军生涯。此前曾有报道国安将不会与37岁的徐云龙续约，但到目前为止，徐云龙还没有做出明确回应。而国安队长这张意味深长的图片，很可能意味着12月24日将会揭晓答案。
去年底，北京国安队球员徐云龙现身著名摇滚乐队“扭曲的机器”演出现场，一展歌喉引爆现场，一曲《国安永远争第一》，道不尽与国安18年500场的不解情缘。此前，徐云龙曾发布海报《决定》，疑似将在12月24日公布自己的去向，引人关注。不过最终徐云龙依旧未宣布自己的去向，仍是一个迷。
2017年1月25日，北京国安队结束了海南冬训，正式返回北京，将于大年初四重新集结赴西班牙进行第二阶段冬训。与此同时，另一则重磅消息从俱乐部传出，效力18年的队魂徐云龙有望在本赛季结束后进入国安俱乐部工作，从事商务开发、经营方面的工作。一旦徐云龙正式进入俱乐部工作，也意味着他的职业生涯将划上句号。而此事最终还需要国安官方来证实，龙队最终的安排，将在节后正式官宣。
