南京市公安局副局长张勇指挥刑侦局和玄武公安分局抽调警力成立专案组，由刑侦局主要领导孙育海指挥专案组，多次前往郑州。
根据户籍信息，祁某一家是2004年举家从河南信阳迁到郑州，但是在信阳市的户籍资料中，祁某一家人里并没有他。从信阳迁到郑州的只有祁某的父母和一个妹妹。但到了郑州落户时，突然多出祁某。专案组翻遍了祁某家原户籍地派出所档案，发现祁某家的原始户籍上，写着长子祁某某，1980年出生。而这个祁某某于1997年9月将户口迁到了干爹家里。
祁某某和祁某会不会是同一个人，为逃避警方追查改名祁某，又改了年龄，洗白了身份？如果确实如此，那么1997年时，祁某的真实年龄为17岁，和警方掌握的嫌疑人年龄相仿。专案组分赴信阳和郑州调查，最终确认，祁某和祁某某是同一个人，他有重大作案嫌疑。
