何念慈和孙芸芸的父亲孙道存1976年结婚，生下了两个女儿和一个儿子，但孙道存和大多数“豪门公子哥”一样生性风流，和女明星颜宁有三个孩子，又爱上演员张琼姿的姐姐张琼玲。面对父亲的花心，孙芸芸始终站在母亲一边，表示“孙夫人与内人都只有一个，就是我妈妈。”但丈夫的接连出轨让何念慈心灰意冷，07年两个人签字离婚了。后来，孙道存娶了初中同学的女儿，比自己小31岁的吴逸萍，女方比自己女儿年纪还小3岁。2010年，何念慈再婚嫁给了加州电子业富商田力行，孙芸芸和姐姐都出席了妈妈的婚礼。
孙芸芸姐姐孙莹莹也是知名的名媛
孙芸芸有一个亲姐姐叫孙莹莹，虽然相貌也姣好，但名气比不上妹妹那么大，曾嫁给电脑软体工程师张汉扬，生育了一个儿子，但08年离婚了。2011年孙莹莹和军火商李华得之子李仕凡订婚。
很多人不喜欢小S的作风，太豪放太自我，精彩揩油男嘉宾，她瞧不上林志玲，就算自己的姐姐大S也偶尔用来开涮。但有一个女人是她唯一佩服又羡慕嫉妒的对象——那就是孙芸芸。
