分配四大难：准入难、公示难、管理难、退出难
科学设置准入门槛，是实现保障房公平分配面临的第一道难关。准入门槛由谁来设，有哪些条件，是问题的关键。目前，绝大多数地方保障房准入门槛由主管部门制定，社会公众无缘参与，有的甚至是地方主管部门领导拍脑袋决定。
准入门槛应该有哪些条件？福建省住房和城乡建设厅住房保障处处长柳文定介绍，保障房建设指标任务从中央到地方，层层分解。但由于各地经济发展、居民收入、保障房实际需求等状况不同，准入门槛也会有较大差异。另外，公共租赁住房、廉租住房、经济适用住房、限价商品房等不同形态保障房，覆盖不同层次的住房困难群体，其门槛条件各有各的针对性和适用范围。但往往是条件多了，操作起来就增加了难度。尤其在申请人收入这块，统计不很全面，导致一些地方出现“开着宝马住保障房”的现象。
江西省九江市房管局副局长吴海林说：“保障性住房建不易，分更难。虽然九江市在分配时设置了五道程序、四道把关、三榜公示，但还是有人浑水摸鱼，其中不乏一些富裕家庭。现在，许多夫妻之间都互不知道对方收入，更何况社区管理人员。在分配住房给最困难的人群时，我们往往依据民政部门提供的低保户名单，但是在分配最低收入之上的一些‘夹心层’时，对其收入的甄别可就难了。”
公开透明监督难，是实现保障房公平分配面临的另一道难关。2010年年底，深圳市政府在保障房大规模开建以来进行第二次分配，就引发了一些社会争议，申请人的信息公示难以令公众信服。深圳市房地产研究中心副主任王锋接受记者采访时说，出现这种情况，关键原因在于政府部门公示的申请人信息透明度不够。
王锋说，此次深圳市保障房申请人终审名单的公示时间为2010年12月31日至2011年1月14日，许多人发现，申请人的具体资产和收入等信息都有不同程度缺失，哪些信息该对外公布也不明确。
“公示就是让公众来发现问题，而不是隐瞒信息让公众发现不了问题。在如何公示上，政府部门应采取开放态度，而不是躲躲闪闪。”福州大学房地产研究所所长王阿忠认为，在保障房分配公示环节，许多地方政府部门第一反应常常是躲避社会监督，从公示环节患上“节假日公示综合征”可见一斑。
第三道难关是管理难。现在各地的机构设置大多为住房保障部门和居委会、物业公司，并由其进行日常管理和核查。实际上，仅靠物业公司的检查、管理是不够的，因为其作为企业，不具有相应的行政职能；物业服务合同约定的只是民事权利义务，不具有行政强制性。
最后一道难关是退出难。柳文定说，申请者何时有私车开了、在哪里又买商品房了、收入是否变化了，等等，这些情况很难及时发现。一旦发现承租人条件超标或违反规定，一般都是让街道社区工作人员上门告知，并耐心做思想工作劝其腾退，难以对承租人强制处罚。
