公立医院应承担公共医疗服务而非逐利
根据北京的医改方案，北京市将建立由卫生局管理的市医院管理机构，研究制订公立医院改革试点方案，将选择一至两个区县开展试点。
对此陈竺表示，针对公立医院的改革难点，北京敢于碰硬，改革方案的设计完整、符合实际，体现了中央深化医改的精神。
“北京在‘大卫生’体制下成立医院管理机构的制度安排，为下一步改革奠定了基础。”陈竺认为，“应该让公立医院作为优质医疗资源承担公共医疗卫生服务，而不是让医疗‘主力部队’脱离‘主战场’，去追逐市场利益。”在“大卫生”体制下管理公立医院，更有利于发挥其在支援基层、参与突发公共卫生应急救治中的作用。
陈竺还建议，北京医保与医疗的互动良好，在此基础上，公立医院改革试点可以进一步探索支付制度改革，如按病种付费、预付制等。
取消“以药养医”并非药事服务没有成本
北京市曾对１１家医院的医疗项目成本进行核算，其中亏损项目占总项目数量的５７％左右，总亏损额中的７７％属于无保本项目的政策性亏损。
“这个现象很不合理。”陈竺说，取消“以药养医”不是说药事服务没有成本，医疗服务、药品服务成本如何得到合理体现，这是一个重要问题。
为落实公立医院政府补助政策，北京市２００９年实现了对医院离退休经费的全额保障，对成本核算中确定的无保本点项目即政策性亏损项目给予补助。
优质医疗资源要“下沉”，鼓励民营医院参与发展
在朝阳医院与医务人员座谈时，有医务人员建议，探索多元化医院格局，引导医疗人才下到基层，如吸收退休医生进社区等。
陈竺对这些建议给予肯定。他指出：“优质资源要下沉，关口要前移，在坚持公立医院主导同时，也希望民营医院参与发展。”政府一方面应保证群众的基本医疗服务，同时也应组织医疗资源满足不同层次的需求。
谈到医师多点执业问题时，陈竺说，卫生部正在制定文件，北京也正在做一些积极探索。
